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775.反制措施(3/5)

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配对原发和转移性肿瘤的系统发育关系

为了研究lim和brm的进化过程(例如,线性与平行发展模型4),我们研究了原发肿瘤和它们匹配的转移瘤之间的系统发育关系。我们推断了基因组改变的序列,然后使用两种独立的算法重建了每种情况下的系统发育树。我们在图3a中列出了每组的三个有代表性的案例。

配对brm的转移内和转移间同质性

由于brm在配对的原发灶和转移灶之间表现出明显低于lim组的突变和拷贝数变异相似性,因此我们随后研究了brm的转移内和转移间的异质性。我们采用了如前所述的方法研究brm的转移内(单个brm的多个区域)和转移间(来自同一患者的多个brm)的异质性,24例,并收集了另外5例肺腺癌患者的brm标本。如图4所示,单个brm病灶被分成来自患者brm91、brm93和brm94的三到四个部分,用于转移内分析。为了进行转移间异质性分析,分别从患者brm95和brm96收集了3个和2个brm病灶。这些样本中最典型的突变驱动基因是egfr和tp53。同样,转移内和转移间的样本中egfr突变是完全一致的。

同一患者的所有样本的突变模式和特征几乎一致(图4a)。此外,我们还重建了每个病例的系统发育树。如图4b所示,所有病例的不同转移样本都可以追溯到单系关系,这表明多个brms的共同起源是占优势的。

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